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利用阿里達(dá)摩院AI算法,首次將新冠病毒疑似病例基因分析縮短至半小時(shí)!

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關(guān)鍵詞:阿里云 AI 疫情 自動(dòng)化

    2月1日,浙江省疾控中心上線自動(dòng)化的全基因組檢測(cè)分析平臺(tái)。利用阿里達(dá)摩院研發(fā)的AI算法,可將原來數(shù)小時(shí)的疑似病例基因分析縮短至半小時(shí)。


    疫情發(fā)生后,達(dá)摩院算法專家顧斐博士立即奔赴浙江省疾控中心,第一時(shí)間針對(duì)新型冠狀病毒基因進(jìn)行特征分析,并推出多個(gè)算法模型。在序列比對(duì)過程中,達(dá)摩院對(duì)算法增加了分布式設(shè)計(jì),有效提升比對(duì)。

    阿里巴巴相關(guān)負(fù)責(zé)人2月1日表示,“可以這么理解,全基因序列的分析比對(duì)會(huì)產(chǎn)生大量數(shù)據(jù),并需要大量計(jì)算,縮短時(shí)間的本質(zhì)就是優(yōu)化算法提高計(jì)算效率和分析能力。”這種分布式的設(shè)計(jì)和區(qū)塊鏈技術(shù)并不相同,而是類似于云計(jì)算。

    當(dāng)前,全國新型冠狀病毒肺炎疫情依然嚴(yán)峻,快速、精確診斷對(duì)于疫情控制尤其重要。公開信息顯示,該病毒是基因組序列最長(zhǎng)的病毒之一,全基因組序列全長(zhǎng)29847bp,臨床診斷需要將患者樣本與該病毒基因序列進(jìn)行比對(duì)才能確定診斷結(jié)果。

    目前醫(yī)院普遍采用核酸檢測(cè)方法,其只能檢測(cè)到病毒基因的局部。由于病毒存在變異的可能性,對(duì)于整個(gè)基因序列來說這種檢測(cè)方法猶如盲人摸象,一旦病毒發(fā)生變異,就可能出現(xiàn)漏檢。

    浙江的全基因組檢測(cè)分析平臺(tái)由浙江省疾病預(yù)防控制中心、阿里達(dá)摩院醫(yī)療AI團(tuán)隊(duì)和杰毅生物技術(shù)公司共同研發(fā)。該平臺(tái)采用不同于核酸檢測(cè)方法的全基因組檢測(cè)技術(shù),對(duì)疑似病例的病毒樣本進(jìn)行全基因組序列分析比對(duì),能夠有效防止病毒變異產(chǎn)生的漏檢,并將原需數(shù)小時(shí)的全基因分析流程減少到半小時(shí),大幅提高疑似病例的確診速度和準(zhǔn)確率。


    浙江省疾控中心基因測(cè)序負(fù)責(zé)人孫逸博士表示:“該平臺(tái)基于阿里云的強(qiáng)大算力與達(dá)摩院新算法可以為病毒的解析提供支撐,基于該平臺(tái),未來還可以在短時(shí)間內(nèi)將檢測(cè)范圍覆蓋整個(gè)確診病例,也為后續(xù)疫苗與藥物研發(fā)打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)?!?/span>

    阿里巴巴相關(guān)人士對(duì)記者透露,后續(xù)達(dá)摩院還將參與疫苗技術(shù)的研發(fā),同樣也是醫(yī)療ai的算法分析和算力支持。

    我們成功從死神手里搶回了寶貴的時(shí)間!要知道,新型冠狀病毒是有史以來基因組序列最長(zhǎng)的病毒之一,全長(zhǎng)29847bp,更可怕的是它隨時(shí)可能發(fā)生變異!傳統(tǒng)局部檢測(cè)早已不大適用,此次浙江采用的全基因組檢測(cè)技術(shù),能有效防止病毒變異產(chǎn)生的漏檢。達(dá)摩院科學(xué)家更針對(duì)性研發(fā)多個(gè)AI算法比對(duì)模型,大大提升了檢測(cè)效率,為后續(xù)疫苗與藥物研發(fā)打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)!


    (審核編輯: KEEP)

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